發生自然災害，尤其是水災的情況下，災民聚居的環境衛生往往較差，這里人口密集，如果水源污染，糞便、垃圾和腐爛變質的有機物質（包括牲畜尸體）得不到有效處理，蚊蠅便會孳生，加上不注意個人衛生和食品衛生，就會得腸道傳染病，如霍亂、痢疾、腸炎、傷寒、副傷寒、甲型肝炎和戊型肝炎。為控制腸道傳染病流行，要及時發現疫情，并以最快的通訊方式向當地疾病預防控制機構報告疫情，管理好病人，搞好環境衛生，并管好廁所，不要隨地大小便，糞便和垃圾定時清理（掩埋或焚燒），消滅蚊蠅孳生場所，病人的糞便和嘔吐物最好加入漂白粉處理。淹死、病死的禽畜不能食用，應掩埋或焚燒，飯前便后要洗手，用漂白粉或漂白粉精片（凈水片）消毒生活用水，不喝生水，食物盡量煮熟再吃，不吃不干凈和變質的食物。