交通部要求，各貨運企業不得運輸易感染活禽進出疫區和易感染禽類產品運出疫區,各客運企業、客運站要加強對旅客攜帶、托運的物品的檢查，嚴禁旅客攜帶疫區的禽類及其產品乘車船出行。各級交通主管部門和運輸企業一旦發現來自疫區的禽類及其產品，要立即暫扣并請動物檢疫部門按規定進行處理。
交通部還要求，港口、客貨運輸站場等相關單位要為動物檢疫部門設立疫情監測點提供方便，并配合其搞好疫情監測工作。如發現禽流感疫情，要立即向動物檢疫、衛生檢疫部門和交通主管部門報告，并配合防疫部門做好對隨車人員、動物的隔離、檢查等工作。
此外，各級交通主管部門要組織好充足運力，加強調度指揮，確保防治禽流感的各種醫療設備、藥品的及時、快速運輸，保障疫情發生地區人民生產生活物資的運輸，為防治禽流感疫情和維護正常社會生產生活秩序提供可靠的后勤保障。
交通部強調，未經省級人民政府批準，任何地區、單位和個人不得在公路上擅自設置動物防疫監督檢查站對過往車輛、人員進行檢查，不得以任何方式中斷交通、破壞公路、阻斷正常運輸，不得以任何理由阻止非疫區間健康畜禽及其產品的運輸流通。
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